Zu der ganzheitlichen Labordiagnostik gehört die Untersuchung des Blutes, des Urins, sowie des Stuhles. Es kann hierbei Auskunft eingeholt werden über: den Funktionsstatus der Organe, die Stoffwechseltätigkeit, das Hormonsystem, das Immunsystem, den Kohlenhydrat-/ Fett- und Eiweißstoffwechsel, die wichtigsten Mineralien und Vitamine, Nahrungsmittelunverträglichkeiten, Schwermetallbelastungen, sowie eventuelle Keimbelastungen im Körper. Je nach Erkrankung bzw. Anamnese können eines oder mehrere dieser Verfahren genutzt werden um der Ursache des Geschehens auf den Grund zu gehen.